Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms