Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms