Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2A3Q8NEV1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms