Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SMIM20Q8N5G0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SMIM20Q8N5G0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms