Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USP43Q70EL4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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