Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms