Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms