Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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