Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5R1Q15078 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms