Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGB1Q14028 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGB1Q14028 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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