Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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