Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP160Q12769 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP160Q12769 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms