Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LGALS3BPQ08380 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS3BPQ08380 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS3BPQ08380 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms