Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC25A11Q02978 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC25A11Q02978 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms