Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC080080.2-201ENST00000624307 590 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms