Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms