Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms