Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB1P82279 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB1P82279 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms