Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCS1P62166 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCS1P62166 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCS1P62166 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCS1P62166 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCS1P62166 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms