Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARFIP2P53365 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP2P53365 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms