Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGP37231 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPARGP37231 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms