Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PEX2P28328 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PEX2P28328 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms