Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRAP18433 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRAP18433 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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