Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTPS1P17812 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms