Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB7P09629 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms