Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOP08100 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOP08100 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOP08100 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHOP08100 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHOP08100 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms