Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms