Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLOCKO15516 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms