Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QRK9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QRK9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QRK9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QRK9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QRK9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QRK9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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