Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NOTOA8MTQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms