Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRXN1Q9ULB1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms