Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM53CQ9NYF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FAM53CQ9NYF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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FAM53CQ9NYF3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FAM53CQ9NYF3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FAM53CQ9NYF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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FAM53CQ9NYF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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FAM53CQ9NYF3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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