Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCLQ9NW38 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms