Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms