Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FANCFQ9NPI8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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