Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms