Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA5Q9BWX5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms