Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms