Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEC22CQ9BRL7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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