Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CPPED1Q9BRF8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CPPED1Q9BRF8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms