Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms