Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGIP1Q9BQI5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms