Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms