Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms