Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71F1Q96KD3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms