Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CPNE4Q96A23 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms