Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPTE2Q6XPS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPTE2Q6XPS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms