Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VASNQ6EMK4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VASNQ6EMK4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms