Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF6Q5VXH4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms