Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPAF1Q5TC12 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms